Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLCA1Q6ZS62 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COLCA1Q6ZS62 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLCA1Q6ZS62 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLCA1Q6ZS62 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COLCA1Q6ZS62 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COLCA1Q6ZS62 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLCA1Q6ZS62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms