Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF493Q6ZR52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF493Q6ZR52 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF493Q6ZR52 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF493Q6ZR52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF493Q6ZR52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF493Q6ZR52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF493Q6ZR52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF493Q6ZR52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF493Q6ZR52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF493Q6ZR52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms