Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP77Q6ZQR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP77Q6ZQR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP77Q6ZQR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP77Q6ZQR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP77Q6ZQR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP77Q6ZQR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP77Q6ZQR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP77Q6ZQR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP77Q6ZQR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP77Q6ZQR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP77Q6ZQR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP77Q6ZQR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP77Q6ZQR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms