Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN54

DEF8, Differentially expressed in FDCP 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF8Q6ZN54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DEF8Q6ZN54 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DEF8Q6ZN54 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DEF8Q6ZN54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DEF8Q6ZN54 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DEF8Q6ZN54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DEF8Q6ZN54 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEF8Q6ZN54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms