Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYHR1Q6ZMK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYHR1Q6ZMK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYHR1Q6ZMK1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYHR1Q6ZMK1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYHR1Q6ZMK1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYHR1Q6ZMK1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYHR1Q6ZMK1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYHR1Q6ZMK1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CYHR1Q6ZMK1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CYHR1Q6ZMK1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYHR1Q6ZMK1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYHR1Q6ZMK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYHR1Q6ZMK1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYHR1Q6ZMK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYHR1Q6ZMK1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms