Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf653Q6YND2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf653Q6YND2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf653Q6YND2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf653Q6YND2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Znf653Q6YND2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf653Q6YND2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf653Q6YND2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf653Q6YND2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf653Q6YND2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf653Q6YND2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Znf653Q6YND2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf653Q6YND2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Znf653Q6YND2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf653Q6YND2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Znf653Q6YND2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf653Q6YND2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Znf653Q6YND2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Znf653Q6YND2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Znf653Q6YND2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf653Q6YND2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf653Q6YND2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf653Q6YND2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf653Q6YND2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf653Q6YND2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf653Q6YND2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms