Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Glis3Q6XP49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Glis3Q6XP49 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Glis3Q6XP49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Glis3Q6XP49 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Glis3Q6XP49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Glis3Q6XP49 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Glis3Q6XP49 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Glis3Q6XP49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Glis3Q6XP49 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Glis3Q6XP49 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Glis3Q6XP49 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Glis3Q6XP49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Glis3Q6XP49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Glis3Q6XP49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Glis3Q6XP49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Glis3Q6XP49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Glis3Q6XP49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Glis3Q6XP49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Glis3Q6XP49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Glis3Q6XP49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Glis3Q6XP49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Glis3Q6XP49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Glis3Q6XP49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Glis3Q6XP49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Glis3Q6XP49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Glis3Q6XP49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Glis3Q6XP49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Glis3Q6XP49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Glis3Q6XP49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms