Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSG1LQ6UXU4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSG1LQ6UXU4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSG1LQ6UXU4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSG1LQ6UXU4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSG1LQ6UXU4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSG1LQ6UXU4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms