Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc57Q6PHN1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc57Q6PHN1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc57Q6PHN1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc57Q6PHN1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc57Q6PHN1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc57Q6PHN1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc57Q6PHN1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc57Q6PHN1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc57Q6PHN1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms