Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HjurpQ6PG16 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HjurpQ6PG16 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HjurpQ6PG16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HjurpQ6PG16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HjurpQ6PG16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HjurpQ6PG16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HjurpQ6PG16 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HjurpQ6PG16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms