Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA3EQ6PEY2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA3EQ6PEY2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA3EQ6PEY2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA3EQ6PEY2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA3EQ6PEY2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA3EQ6PEY2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA3EQ6PEY2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA3EQ6PEY2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms