Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SvoplQ6PDF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SvoplQ6PDF3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SvoplQ6PDF3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SvoplQ6PDF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SvoplQ6PDF3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SvoplQ6PDF3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SvoplQ6PDF3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SvoplQ6PDF3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SvoplQ6PDF3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SvoplQ6PDF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SvoplQ6PDF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SvoplQ6PDF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SvoplQ6PDF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms