Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GALNT18Q6P9A2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GALNT18Q6P9A2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GALNT18Q6P9A2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GALNT18Q6P9A2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GALNT18Q6P9A2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GALNT18Q6P9A2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GALNT18Q6P9A2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALNT18Q6P9A2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALNT18Q6P9A2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GALNT18Q6P9A2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms