Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D4

Cep135, Centrosomal protein of 135 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep135Q6P5D4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep135Q6P5D4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep135Q6P5D4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep135Q6P5D4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cep135Q6P5D4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cep135Q6P5D4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cep135Q6P5D4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cep135Q6P5D4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cep135Q6P5D4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cep135Q6P5D4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cep135Q6P5D4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cep135Q6P5D4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cep135Q6P5D4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cep135Q6P5D4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cep135Q6P5D4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep135Q6P5D4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms