Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASC4Q6P4E1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASC4Q6P4E1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC4Q6P4E1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC4Q6P4E1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC4Q6P4E1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASC4Q6P4E1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASC4Q6P4E1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASC4Q6P4E1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC4Q6P4E1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASC4Q6P4E1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASC4Q6P4E1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC4Q6P4E1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms