Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC70Q6NSX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC70Q6NSX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC70Q6NSX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC70Q6NSX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC70Q6NSX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC70Q6NSX1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC70Q6NSX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC70Q6NSX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC70Q6NSX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms