Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CENPPQ6IPU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CENPPQ6IPU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPPQ6IPU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPPQ6IPU0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPPQ6IPU0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPPQ6IPU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPPQ6IPU0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPPQ6IPU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPPQ6IPU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPPQ6IPU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPPQ6IPU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPPQ6IPU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPPQ6IPU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPPQ6IPU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms