Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms