Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCTD16Q68DU8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCTD16Q68DU8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCTD16Q68DU8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KCTD16Q68DU8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCTD16Q68DU8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCTD16Q68DU8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCTD16Q68DU8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCTD16Q68DU8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCTD16Q68DU8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCTD16Q68DU8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCTD16Q68DU8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCTD16Q68DU8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms