Protein–RNA interactions for Protein: Q68D51

DENND2C, DENN domain-containing protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2CQ68D51 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DENND2CQ68D51 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND2CQ68D51 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND2CQ68D51 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND2CQ68D51 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DENND2CQ68D51 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2CQ68D51 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2CQ68D51 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2CQ68D51 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND2CQ68D51 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND2CQ68D51 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2CQ68D51 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND2CQ68D51 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms