Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp9cQ66X01 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp9cQ66X01 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp9cQ66X01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp9cQ66X01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp9cQ66X01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp9cQ66X01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp9cQ66X01 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp9cQ66X01 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrp9cQ66X01 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms