Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ctnna3Q65CL1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ctnna3Q65CL1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctnna3Q65CL1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctnna3Q65CL1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ctnna3Q65CL1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ctnna3Q65CL1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ctnna3Q65CL1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ctnna3Q65CL1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ctnna3Q65CL1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ctnna3Q65CL1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ctnna3Q65CL1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms