Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprcapQ64697 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PtprcapQ64697 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtprcapQ64697 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtprcapQ64697 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprcapQ64697 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprcapQ64697 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprcapQ64697 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprcapQ64697 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprcapQ64697 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtprcapQ64697 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PtprcapQ64697 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprcapQ64697 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprcapQ64697 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprcapQ64697 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprcapQ64697 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprcapQ64697 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprcapQ64697 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprcapQ64697 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprcapQ64697 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprcapQ64697 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprcapQ64697 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprcapQ64697 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprcapQ64697 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprcapQ64697 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprcapQ64697 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprcapQ64697 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprcapQ64697 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprcapQ64697 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprcapQ64697 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PtprcapQ64697 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprcapQ64697 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms