Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn3Q64691 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn3Q64691 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn3Q64691 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn3Q64691 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn3Q64691 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn3Q64691 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn3Q64691 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn3Q64691 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn3Q64691 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn3Q64691 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn3Q64691 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn3Q64691 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn3Q64691 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn3Q64691 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn3Q64691 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn3Q64691 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Capn3Q64691 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn3Q64691 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn3Q64691 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn3Q64691 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms