Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2a3Q64518 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2a3Q64518 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2a3Q64518 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2a3Q64518 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2a3Q64518 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2a3Q64518 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2a3Q64518 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2a3Q64518 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms