Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Npdc1Q64322 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npdc1Q64322 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npdc1Q64322 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npdc1Q64322 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npdc1Q64322 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npdc1Q64322 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npdc1Q64322 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npdc1Q64322 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Npdc1Q64322 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms