Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup62Q63850 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nup62Q63850 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup62Q63850 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup62Q63850 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup62Q63850 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nup62Q63850 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nup62Q63850 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nup62Q63850 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nup62Q63850 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup62Q63850 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup62Q63850 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms