Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkd1Q62101 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkd1Q62101 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkd1Q62101 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkd1Q62101 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkd1Q62101 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkd1Q62101 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkd1Q62101 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms