Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grik5Q61626 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grik5Q61626 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Grik5Q61626 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grik5Q61626 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grik5Q61626 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grik5Q61626 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grik5Q61626 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grik5Q61626 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Grik5Q61626 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Grik5Q61626 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grik5Q61626 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grik5Q61626 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grik5Q61626 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Grik5Q61626 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grik5Q61626 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms