Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf4Q61382 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf4Q61382 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf4Q61382 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf4Q61382 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf4Q61382 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf4Q61382 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf4Q61382 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf4Q61382 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf4Q61382 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf4Q61382 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf4Q61382 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms