Protein–RNA interactions for Protein: Q61129

Cfi, Complement factor I, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfiQ61129 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CfiQ61129 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfiQ61129 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfiQ61129 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CfiQ61129 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfiQ61129 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfiQ61129 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfiQ61129 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfiQ61129 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfiQ61129 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CfiQ61129 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CfiQ61129 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CfiQ61129 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CfiQ61129 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CfiQ61129 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CfiQ61129 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CfiQ61129 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfiQ61129 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfiQ61129 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms