Protein–RNA interactions for Protein: Q60860

Ltc4s, Leukotriene C4 synthase, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltc4sQ60860 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ltc4sQ60860 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltc4sQ60860 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltc4sQ60860 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ltc4sQ60860 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ltc4sQ60860 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ltc4sQ60860 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ltc4sQ60860 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ltc4sQ60860 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltc4sQ60860 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms