Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SkiQ60698 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SkiQ60698 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SkiQ60698 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SkiQ60698 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SkiQ60698 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SkiQ60698 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SkiQ60698 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SkiQ60698 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SkiQ60698 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SkiQ60698 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SkiQ60698 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SkiQ60698 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SkiQ60698 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SkiQ60698 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SkiQ60698 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SkiQ60698 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SkiQ60698 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SkiQ60698 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SkiQ60698 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SkiQ60698 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SkiQ60698 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SkiQ60698 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SkiQ60698 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SkiQ60698 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SkiQ60698 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SkiQ60698 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SkiQ60698 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SkiQ60698 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SkiQ60698 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SkiQ60698 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SkiQ60698 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SkiQ60698 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SkiQ60698 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SkiQ60698 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SkiQ60698 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SkiQ60698 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SkiQ60698 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SkiQ60698 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms