Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScinQ60604 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ScinQ60604 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScinQ60604 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ScinQ60604 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ScinQ60604 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScinQ60604 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ScinQ60604 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ScinQ60604 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ScinQ60604 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ScinQ60604 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScinQ60604 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ScinQ60604 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ScinQ60604 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ScinQ60604 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScinQ60604 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScinQ60604 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScinQ60604 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScinQ60604 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScinQ60604 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScinQ60604 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScinQ60604 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ScinQ60604 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms