Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXB2Q5VYV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXB2Q5VYV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXB2Q5VYV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXB2Q5VYV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXB2Q5VYV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXB2Q5VYV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXB2Q5VYV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXB2Q5VYV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXB2Q5VYV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXB2Q5VYV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXB2Q5VYV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXB2Q5VYV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXB2Q5VYV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXB2Q5VYV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms