Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF6Q5VXH4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF6Q5VXH4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF6Q5VXH4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF6Q5VXH4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF6Q5VXH4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF6Q5VXH4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF6Q5VXH4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF6Q5VXH4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF6Q5VXH4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms