Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM46CQ5VWP2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM46CQ5VWP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM46CQ5VWP2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM46CQ5VWP2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM46CQ5VWP2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM46CQ5VWP2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM46CQ5VWP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM46CQ5VWP2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms