Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf135Q5VTT2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9orf135Q5VTT2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9orf135Q5VTT2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf135Q5VTT2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf135Q5VTT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf135Q5VTT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf135Q5VTT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf135Q5VTT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf135Q5VTT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms