Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDH0

DDI2, Protein DDI1 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI2Q5TDH0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDI2Q5TDH0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDI2Q5TDH0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDI2Q5TDH0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDI2Q5TDH0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDI2Q5TDH0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDI2Q5TDH0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDI2Q5TDH0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDI2Q5TDH0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDI2Q5TDH0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDI2Q5TDH0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDI2Q5TDH0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDI2Q5TDH0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDI2Q5TDH0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms