Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
MAGI3Q5TCQ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.32■■■■■ 4.53
MAGI3Q5TCQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
MAGI3Q5TCQ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.24■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
MAGI3Q5TCQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
MAGI3Q5TCQ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
MAGI3Q5TCQ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
MAGI3Q5TCQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
MAGI3Q5TCQ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
MAGI3Q5TCQ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
MAGI3Q5TCQ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
MAGI3Q5TCQ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
MAGI3Q5TCQ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
MAGI3Q5TCQ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
MAGI3Q5TCQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
MAGI3Q5TCQ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
MAGI3Q5TCQ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
MAGI3Q5TCQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
MAGI3Q5TCQ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
MAGI3Q5TCQ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
MAGI3Q5TCQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
MAGI3Q5TCQ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
MAGI3Q5TCQ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.63■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
MAGI3Q5TCQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
MAGI3Q5TCQ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
MAGI3Q5TCQ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
MAGI3Q5TCQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
MAGI3Q5TCQ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
MAGI3Q5TCQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
MAGI3Q5TCQ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
MAGI3Q5TCQ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
MAGI3Q5TCQ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms