Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC9C2Q5TAH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SLC9C2Q5TAH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SLC9C2Q5TAH2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SLC9C2Q5TAH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC9C2Q5TAH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC9C2Q5TAH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC9C2Q5TAH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC9C2Q5TAH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC9C2Q5TAH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC9C2Q5TAH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC9C2Q5TAH2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SLC9C2Q5TAH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SLC9C2Q5TAH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SLC9C2Q5TAH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC9C2Q5TAH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SLC9C2Q5TAH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC9C2Q5TAH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SLC9C2Q5TAH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC9C2Q5TAH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLC9C2Q5TAH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC9C2Q5TAH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC9C2Q5TAH2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms