Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms