Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyfip2Q5SQX6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyfip2Q5SQX6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cyfip2Q5SQX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cyfip2Q5SQX6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyfip2Q5SQX6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyfip2Q5SQX6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Cyfip2Q5SQX6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyfip2Q5SQX6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyfip2Q5SQX6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyfip2Q5SQX6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyfip2Q5SQX6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyfip2Q5SQX6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms