Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phf12Q5SPL2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf12Q5SPL2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf12Q5SPL2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phf12Q5SPL2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phf12Q5SPL2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf12Q5SPL2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phf12Q5SPL2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf12Q5SPL2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phf12Q5SPL2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms