Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PkdccQ5RJI4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PkdccQ5RJI4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PkdccQ5RJI4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PkdccQ5RJI4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PkdccQ5RJI4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PkdccQ5RJI4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PkdccQ5RJI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PkdccQ5RJI4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PkdccQ5RJI4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PkdccQ5RJI4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PkdccQ5RJI4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PkdccQ5RJI4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PkdccQ5RJI4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PkdccQ5RJI4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PkdccQ5RJI4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms