Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacna2d4Q5RJF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna2d4Q5RJF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cacna2d4Q5RJF7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacna2d4Q5RJF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacna2d4Q5RJF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacna2d4Q5RJF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna2d4Q5RJF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna2d4Q5RJF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna2d4Q5RJF7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna2d4Q5RJF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna2d4Q5RJF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna2d4Q5RJF7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna2d4Q5RJF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna2d4Q5RJF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms