Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trim58Q5NCC9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trim58Q5NCC9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trim58Q5NCC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trim58Q5NCC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trim58Q5NCC9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trim58Q5NCC9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Trim58Q5NCC9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim58Q5NCC9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim58Q5NCC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim58Q5NCC9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim58Q5NCC9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim58Q5NCC9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim58Q5NCC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim58Q5NCC9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Trim58Q5NCC9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trim58Q5NCC9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trim58Q5NCC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Trim58Q5NCC9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Trim58Q5NCC9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Trim58Q5NCC9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trim58Q5NCC9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim58Q5NCC9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim58Q5NCC9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trim58Q5NCC9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms