Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOHLH1Q5JUK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOHLH1Q5JUK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOHLH1Q5JUK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOHLH1Q5JUK2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOHLH1Q5JUK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms