Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP78Q5JTW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP78Q5JTW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP78Q5JTW2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP78Q5JTW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP78Q5JTW2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP78Q5JTW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms