Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFHC2Q5JST6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFHC2Q5JST6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFHC2Q5JST6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFHC2Q5JST6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EFHC2Q5JST6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFHC2Q5JST6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EFHC2Q5JST6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFHC2Q5JST6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFHC2Q5JST6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EFHC2Q5JST6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EFHC2Q5JST6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFHC2Q5JST6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFHC2Q5JST6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFHC2Q5JST6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFHC2Q5JST6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFHC2Q5JST6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHC2Q5JST6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHC2Q5JST6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFHC2Q5JST6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFHC2Q5JST6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFHC2Q5JST6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms